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研究工作

主要从事研究工作：

（1）分枝杆菌分子水平的菌种鉴定、微进化和分布；
  （2）微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和结构生物学及致病机制等研究；
  （3）基于新型纳米材料微流控芯片的临床诊断技术开发；
  （4）基于生物组学的肿瘤分子靶标的发现和功能研究；
  （5）肿瘤免疫细胞治疗研究。

课题组联合复旦大学遗传所、上海交通大学医学院和上海市公共卫生临床中心、上海成海生物科技有限公司、南京荣凯生物科技有限公司等单位，通过应用基因组学、蛋白质组学、糖生物学、免疫组学和生物信息学理论和技术在分枝杆菌耐药分子机制和免疫诊断两个方向开展创新性和应用性研究。根据学生意愿选派部分研究生到上海交通大学医学院和上海市公共卫生临床中心从事科研工作，实行双向培养。

2014年，与经国家外专局审批的我校高端外项专家和“世界著名科学家来鄂讲学计划”教授―美国路易维尔大学细胞治疗研究所Haval·Shirwan教授合作从事细胞治疗方面的研究。共同开展分子免疫调节和重组蛋白疫苗应用于临床治疗的研究，有望应用于疫力低下/缺陷人群及癌症患者的治疗和防治，以期对我国细胞免疫治疗有一个推动。

近年，团队工作重点是基于蛋白质和糖标志物的免疫诊断及肿瘤免疫细胞治疗工作，集中于筛选具有免疫活性的蛋白质、糖标志物及抗原（抗体）检测技术平台的理论和应用研究。团队与本领域世界顶尖级研究机构美国   NIH 结核病研究所所长Clifton   Barry,Ph.D.和中国军事医学科学院、中国蛋白质组学国家重点实验室等合作，共同开展胞壁糖组功能及肿瘤免疫细胞治疗研究。

课题组现有平台技术如下：

研究方向1：细菌平台

主要研究工作包括：细菌表型菌种鉴定和药敏检测和MIC检测；菌种冻存，储存和保管；菌株复活和扩大培养等工作。

研究方向2：生化平台

主要研究工作包括：细菌胞壁脂聚糖、糖脂类提取及其测定和功能分析；胞壁脂肪酸(分枝菌酸)测定及其菌种鉴定；高效液相色谱(HPLC)、质谱（MS）和核磁共振（NMR）等生化分析。

研究方向3：分子生物学平台

主要研究工作包括：PCR及其序列相关测定和分析技术：(1)基于分子水平的菌种鉴定、微进化和分布及分子流行病分析；|(2)基因突变位点检测。基因的克隆及其原核表达与蛋白纯化。

研究方向4：免疫及其细胞生物学平台

主要研究工作包括：体液免疫检测、细胞免疫检测、病原和宿主细胞相互作用。重点是新型标志物，包括蛋白和脂聚糖对宿主巨噬细胞和树突状细胞的调节作用。

研究方向5：免疫治疗平台

肿瘤免疫新机制及治疗新策略、新方法的基础研究。研究内容：重点支持肿瘤免疫检查点阻断机制及基于肿瘤特异性嵌合抗原受体重组T细胞治疗的新策略、新方法的基础研究。

研究方向：

微生物与分子免疫

主要承担的科研项目：

1、“十三五”国家科技重大专项“组合型分子标识及产品优化”（2017ZX10201301-003-003）,   2017.1-2020.12,   主持，经费120.13万。

2、“十二五”国家科技重大专项，外协任务课题“分枝杆菌菌种鉴定及MIC值的测定”、2013/09.10-2015/09.10, 主持(2013ZX10003003-004-002)。

3、“十一五”国家科技重大专项外协任务课题“关于结核临床耐药菌株和血清样品材料的取材、分离和技术服务”,   2009/12-2010/12, 主持（2008ZX10003-003）。

4、湖北省教育厅科学技术研究计划重点项目，“武汉地区分枝杆菌利福平、异烟肼耐药机制及分子流行病学研究”，D20121809，2012.1-2013.12,   主持。

5、“抗原表位MHC四聚体制备及其评估”，南京荣凯生物科技有限公司，2015.9.1-2017.12.30, 主持。

代表性论文与著作

1、Yu XL,   Wen ZL, Chen GZ,etal. olecular characterization of multidrug-resistant   Mycobacterium tuberculosis isolated from South-central in China. The Journal   of Antibiotics. 2014,67(4):291-297.

2、yu XL,   Lu L, Chen GZ,etal. Identification and Characterization of   Non-Tuberculous Mycobacteria Isolated fromTuberculosis   Suspects in Southern-central China. Plos one. 2014.9(12): e114353.

3、Peng J⁺, Yu X⁺, Cui Z, Xue W   ,etal. Multi-Fluorescence Real-Time PCR Assay for

Detection of RIF And INH   Resistance of M.tuberculosis[J].Frontiers in Microbiology.   2016,7(618):61801-61810 .  

4、Jialing Ruan,   Gaobo Chen, Hang Lei, Xiaoli Yu^*,etal. On the   assessment method　based　on correlation   weighted comprehensive nutritional index in the Three Gorges Reservoir.   Advances Environmental Engineering-Advanced Materials Research,2012,

559:773-776.

5、Zhang   Shaopeng, Wu Qihang, Lei Hang, Zheng Hui, Zhou Fang, Sun Zhanqiang, Zhao   Junwei, Yu   Xioali^*, Zhang Shulin.   Mannosylated structures of mycobacterial lipoarabinomannans facilitate the   maturation and activation of dendritic cells. Cellular immunology   2018.S0008-8749(18)30337-X

6、Zhao-Xin Liu; Zhenggang Han; Xiao-Yu; Guoyuan Wen; Chi Zeng. Crystal

Structure of the Catalytic Domain of MCR-1(cMCR-1) in Complex with D -Xylose. crystals. 2018,8(4),172

7、孙妍,王心倩,吴启航,赵隆麒,李海波,占卫红,张舒林,余晓丽^*. 分枝杆菌Rv2986c对小鼠树突状细胞成熟和功能的影响[J]. 免疫学杂志,2017,33(12):1028-1033.

8、余晓丽，孙战强，周晨俊，等．分枝杆菌Rv1168c蛋白的基因表达、纯化及结构分析〔J〕.微生物学报，2010，50(7)：931～936.

专利成果：

1、余晓丽、孙战强、张舒林. 一种结核分枝杆菌药敏检测显色剂及其药敏检测方法，申请号：201810243652.6    

2、余晓丽，孙战强、张舒林. 一种Rv2986c蛋白的制备及其在结核病诊断与免疫防治中的应用. 申请号:   201510675135.2

3、张舒林，孙占强，余晓丽，张朝宝，王洪海.分枝杆菌最低抑菌浓度检测系统的制备方法，申请号:   201210005116.5  

4、张舒林，余晓丽，孙战强.一种应用于结核病快速诊断的糖芯片、其制备方法及采用其的结核病诊断试剂盒，申请号：20120185439.7

5、张舒林，余晓丽，王洪海. 结核分枝杆菌复合群检测及菌种鉴定的核酸探针阵列及其应用，申请号：200910054536.0　等

其它：

余晓丽，生物与制药工程学院教授，硕士生导师，现任校民盟主委，湖北省民盟第十三届委员会委员和科技专委会副主任。中国细胞生物学学会会员、全国糖生物学会会员和中华医学会结核病学分会会员。复旦大学“十一五”重大专项咨询专家；SCI期刋论文“The   International Journal of Tuberculosis and Lung Disease”审稿专家；教育部学位中心博士、硕士论文肓审专家。湖北省科学技术奖励评审专家，湖北省科技厅项目评审专家，湖北省大学生科技创业专项计划评审专家，武汉市科技局项目评审（新产品及武汉市青年科技晨光计划评审）专家。

承担、参与十一五、十二五、十三五国家科技科技重大专项等9项；主持国家重点基础研究发展计划（973计划）子项目1 项；厅局级项目 2 项，共十余项。专利9项。发表《Frontiers in Microbiology》、《The Journal of   Antibiotics》、《PloS   One》、《微生物学报》等SCI、EI收录论文七十余篇；主编和参编教材和论著8部；获省、地厅级二等奖五项。