通讯地址：武汉市东西湖区常青花园学府南路68号武汉轻工大学生化楼512

 电子邮箱：23113176@whpu.edu.cn

        研究方向：  

                          1.  多模态生物合成大数据挖掘；

                          2. AI 驱动的生物合成途径智能设计方法研究；

                          3.  基于AI+大数据的酶功能预测与设计优化方法研究；

                            4.  基于大语言模型研发多个垂直领域的智能助手；

教育经历：

2018.09至2021.06，中科院上海营养与健康研究所，博士，计算生物学

2014.09至2016.06，武汉大学，硕士，制药工程

2010.09至2014.06，河南中医药大学，本科，制药工程

工作经历：

2023.09至今，武汉轻工大学，生命科学与技术学院，讲师

2021.07至2023.09，武汉智化科技有限公司，化学信息学高级算法工程师

2017.09至2018.08，中科院上海营养与健康研究所，科研助理

2016.07至2017.08，中科院天津工业生物技术研究所，科研助理

代表性论著：

1. Ding S, Tian Y, Liu D, et al. RxnCluster: A Web-Based Tool for Exploring Reaction Clusters Leading to Target Molecules by Digitalizing Typical Biosynthetic Patterns[J]. ACS Synthetic Biology, 2025, 14(8): 3154-3162.

2. Ding S, Liu D, Tian Y, et al. From reactants to products: computational methods for biosynthetic pathway design[J]. Synthetic and Systems Biotechnology, 2025.

3. Ding S, Tian Y, Cai P, et al. novoPathFinder: a webserver of designing novel-pathway with integrating GEM-model[J]. Nucleic acids research, 2020, 48(W1): W477-W487.

4. Ding S, Jiang, et al. Application of artificial intelligence and big data technology in synthesis planning. SCIENTIA SINICE Chimica.2023.53.66-78.

5. Ding S, Cai P, Yuan L, et al. CF-targeter: a rational biological cell factory targeting platform for biosynthetic target chemicals[J]. ACS Synthetic Biology, 2019, 8(10): 2280-2286.

6. Ding S, Liao X, Tu W, et al. EcoSynther: a customized platform to explore the biosynthetic potential in E. coli[J]. ACS chemical biology, 2017, 12(11): 2823-2829.

7. Tu W^#, Ding S^#, Wu L, et al. SynBioEcoli: a comprehensive metabolism network of engineered E. coli in three dimensional visualization[J]. Quantitative Biology, 2017, 5(1): 99-104.

其他相关研究：https://scholar.google.com/citations?hl=en&user=Z5SuqcEAAAAJ

主持/参与科研项目：

1. 构建经验策略驱动型天然产物生物合成途径设计工具，科研启动经费，2023-10至2026-09，6万元，主持，在研。

2：国家重点研发计划项目，2017YFC1601702，食品风险组分毒理学通路鉴别确证技术研究，2018/01-2021/12, 70万，子课题负责人，结题。

3. 国家自然科学基金面上项目，农杆菌CHJ606降解塑料抗氧化剂2,4-二叔丁基苯酚的途径及分子机制研究，2025/01/01-2028/12/31，参与；在研；

4：国家重点研发计划项目，2019YFA0904301，高质量工业微生物全基因组代谢网络模型库构建新方法，2020.1-2024.12，2216万，参与，结题。

所获奖励：

2025年指导本科生参与湖北省大学生生物实验技能竞赛获省二等奖；

2021 年获中科院优秀毕业生；

2021年获北京市优秀毕业生；

2020 年获中科院院长奖学金（Top 1%）；

2020年获博士研究生国家奖学金；

2020年获中科院三好学生标兵；

2019年获博士研究生国家奖学金；

欢迎对本课题组感兴趣的同学联系

QQ: 164362170