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研究工作

（1）分枝杆菌分子水平的菌种鉴定、微进化和分布；

（2）基于微生物基因组学、转录组学、蛋白质组学和结构生物学及致病机制等生物医学相关研究；

（3）基于新型纳米材料微流控芯片的临床诊断技术开发；

（4）基于生物组学的肿瘤分子靶标的发现和功能研究；

（5）肿瘤免疫细胞治疗研究。

课题组联合复旦大学遗传所、上海交通大学医学院和上海市公共卫生临床中心、厦门集庆生物医药科技有限公司、南京荣凯生物科技有限公司等单位，通过应用基因组学、蛋白质组学、糖生物学、免疫组学和生物信息学理论和技术在分枝杆菌耐药分子机制和免疫诊断两个方向开展创新性和应用性研究。根据学生意愿选派部分研究生到上海交通大学医学院，上海市公共卫生临床中心从事科研工作和厦门集庆生物医药科技有限公司，实行双向培养。

课题组现有平台技术如下：

研究方向1：细菌平台

主要研究工作包括：细菌表型菌种鉴定和药敏检测和MIC检测；菌种冻存，储存和保管；菌株复活和扩大培养等工作。

研究方向2：生化平台

主要研究工作包括：细菌胞壁脂聚糖、糖脂类提取及其测定和功能分析；胞壁脂肪酸(分枝菌酸)测定及其菌种鉴定；高效液相色谱(HPLC)、质谱（MS）和核磁共振（NMR）等生化分析。

研究方向3：分子生物学平台

主要研究工作包括：PCR及其序列相关测定和分析技术：（1）基于分子水平的菌种鉴定、微进化和分布及分子流行病分析；（2）基因突变位点检测。基因的克隆及其原核表达与蛋白纯化。

研究方向4：免疫及其细胞生物学平台

主要研究工作包括：体液免疫检测、细胞免疫检测、病原和宿主细胞相互作用。重点是新型标志物，包括蛋白和脂聚糖对宿主巨噬细胞和树突状细胞的调节作用。

研究方向5：免疫治疗平台

肿瘤免疫新机制及治疗新策略、新方法的基础研究。研究内容：重点支持肿瘤免疫检查点阻断机制及基于肿瘤特异性嵌合抗原受体重组T细胞治疗的新策略、新方法的基础研究。

研究方向：

微生物与分子免疫

主要承担的科研项目：

1、“十三五”国家科技重大专项“组合型分子标识及产品优化”（2017ZX10201301-003-003）,   2017.1-2020.12,   主持，经费120.13万。

2、武汉市2020年度应用基础前沿项目，基于分枝杆菌HupB和LAM抗原诱导的肺部疾病时空免疫应答机制及其临床价值研究，项目编号：2020.2.6.1.12231，2020.8-2022.12，主持，经费50万

3、“十二五”国家科技重大专项（2013ZX10003003-004-002），外协任务课题“分枝杆菌菌种鉴定及MIC值的测定”、2013/09.10-2015/09.10, 主持。

4、“十一五”国家科技重大专项外协任务课题（2008ZX10003-003）“关于临床耐药菌株和血清样品材料的取材、分离和技术服务”,   2009/12-2010/12, 主持。

5、湖北省教育厅科学技术研究计划重点项目，“武汉地区分枝杆菌利福平、异烟肼耐药机制及分子流行病学研究”，D20121809，2012.1-2013.12,   主持。

6、“抗原表位MHC四聚体制备及其评估”，南京荣凯生物科技有限公司，2015.9.1-2017.12.30, 主持。

代表性论文与著作

1.Jialing   Ruan, Gaobo Chen, Hang Lei, Xiaoli Yu^*,etal. On the   assessment method　based　on correlation   weighted comprehensive nutritional index in the Three Gorges Reservoir.   Advances Environmental Engineering-Advanced Materials Research,2012,

559:773-776.

2.Yu   XL,Wen ZL,Chen GZ,etal. olecular characterization of   multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis isolated from South-central in   China. The Journal of Antibiotics. 2014,67(4):291-297.

3.yu XL,   Lu L,Chen GZ,etal. Identification and Characterization of   Non-Tuberculous Mycobacteria Isolated fromTuberculosis   Suspects in Southern-central China. Plos one. 2014.9(12): e114353.

4.Peng J⁺, Yu X⁺, Cui Z, Xue W   ,etal. Multi-Fluorescence Real-Time PCR Assay for

Detection of RIF And INH   Resistance of M.tuberculosis[J].Frontiers in Microbiology.   2016,7(618):61801-61810 .  

5.Zhang   Shaopeng, Wu Qihang, Lei Hang, Zheng Hui, Zhou Fang, Sun Zhanqiang, Zhao   Junwei, Yu   Xioali^*, Zhang Shulin.   Mannosylated structures of mycobacterial lipoarabinomannans facilitate the   maturation and activation of dendritic cells. Cellular immunology   2018.S0008-8749(18)30337-X

6.Zhao-Xin Liu; Zhenggang Han; Xiao-Yu; Guoyuan Wen; Chi Zeng. Crystal

Structure of the Catalytic Domain of MCR-1(cMCR-1) in Complex with D -Xylose. crystals. 2018,8(4),172

7.Xiaoli Yu，Hui Zheng,   Fang Zhou,Peng Hu, Hualin Wang,Na Li,Juncai He,Peidong Wang, Lu Zhang,   Hongsheng Men,Jie Xiang and Shulin Zhang . Phenotypic and molecular   characterisation of a novel species, Mycobacterium hubeiense sp., isolated   from the sputum of a patient with secondary tuberculosis in Hubei of China.   Epidemiol Infect. 2020;148:e49.

8.Lu Zhang,   Hualin Wang,Na Li, Peng Hu, Zhaoqin Zhu, Wei Wang ,Yanzheng Song,

Zilu Wen,Xiaoli   Yu^* and Shulin Zhang.

Label-Free   Mass Spectrometry-Based Plasma Proteomics Identified LY6D, DSC3, CDSN,   SERPINB12, and SLURP1, as Novel Protein Biomarkers For Pulmonary   Tuberculosis. Current Proteomics. 2021.1(18),1-12

9.Xiaoli Yu, Xuefang Li, Peng Hu, Yang Li, Fang Zhou, Ke Zhang*, Xinqian Wang, Danni Wang, Shulin Zhang.Mycobacterium tuberculosis HtdY, a Novel Immunostimulatory Antigen, Drives Th1-type T Cell Immunity via TLR4-mediated Activation of Dendritic Cells[J].Cell Mol Biol .2021.5(67),   1-6    

专利成果：

1.余晓丽等.分枝杆菌融合蛋白在疾病临床诊断价值评估及应用.中国，专利号：ZL 2020 1066286.X

2.余晓丽等.HupB重组蛋白的基因及其免疫学应用，中国，专利号：ZL   202110135064.2

3.余晓丽等. 一种分枝杆菌药敏检测显色剂及其药敏检测方法，申请号：201810243652.6    

4.余晓丽等. 一种Rv2986c蛋白的制备及其在疾病诊断与免疫防治中的应用. 申请号: 201510675135.2

其它：

余晓丽，生物与制药工程学院，教授，博士生导师，现任校民盟委员会主委，湖北省民盟科技专委会副主任和第十三届委员会委员。湖北省生化学会副理事，中国细胞生物学学会会员、全国糖生物学会会员和中华医学会会员。

国家科技专家库、湖北科技专家在库专家。复旦大学“十一五”重大专项咨询专家；“The   International Journal of Tuberculosis and Lung Disease”等SCI期刋论文审稿专家。

承担、参与 十一五、十二五、十三五国家科技科技重大专项等9项；主持国家重点基础研究发展计划（973计划）子项目1 项；武汉市基础应用前沿等厅局级项目3 项，共十余项。专利十余项。发表《Frontiers in Microbiology》、《The Journal of Antibiotics》、《Cellular Immunology》、《Epidemiology and infection》等SCI、EI收录论文七十余篇；独著、主编和参编教材和论著8部；获省、地厅级二等奖五项。

主授《细胞生物学》。